De klasse Trebouxiophyceae T. Friedl kent 5 orden en een lijst incertae sedis.
De orden:
| Chlorellales H.C.Bold & M.J.Wynne | Phyllosiphonales F.E. Round | Trebouxiales Friedl |
| Microthamniales M.Melkonian | Prasiolales F.E.Fritsch | Trebouxiophyceae orde incertae sedis |
